21 Facultad de Johns Hopkins amenazan con renunciar a bordo, si la revista no se retrae de papel – reloj retirada al reloj retracción zona anóxica

Más de 20 miembros de la facultad en la Universidad Johns Hopkins han firmado una carta a los informes científicos diciendo que van a renunciar a la junta editorial si la revista no se retrae un documento de 2016.

El papel es problemático, argumentan, debido a que un biólogo de la Universidad Johns Hopkins afirma que plagió su trabajo. Uno de los colegas de que el biólogo de Hopkins ya ha dimitido del consejo de redacción de la revista sobre su decisión de corregir (y no retraer) el papel; la semana pasada, otras 21 personas dijeron a la revista que iban a hacer lo mismo.

La carta a la revista también incluye una comparación lado a lado entre el 2016 y el documento de trabajo que supuestamente plagiado.


Los miembros de la junta en cuenta:

Este no es un caso sutil … por lo tanto si no retraer el papel de plagio, todos vamos a renunciar a su consejo editorial.zona anóxica

La campaña fue organizada por Steven Salzberg, que nos dijo que aprendió del debate después de la cerveza de Michael, que afirma el documento 2016 levantó su trabajo, remitió el artículo publicado en el tema la semana pasada a alguna facultad en Johns Hopkins. Salzberg – que se basa en Hopkins, pero no en el consejo de redacción en los informes científicos – pasó por los nombres en el consejo editorial de la revista y en contacto con todo el mundo basado en Hopkins, para ver si ellos también estarían dispuestos a renunciar por la conducta de la revista.

Me acabo de escribir a todos ellos.

Hasta el momento, 21 personas han firmado sus nombres a la carta.

Salzberg nos dijo que se interesó en el caso porque él cree que el papel es “muy obviamente copiado:”

Este no es un caso sutil de plagio.zona anóxica es bastante evidente.

Aunque la cerveza en contacto con la revista con sus preocupaciones, la revista decidió emitir un aviso de corrección, que cita “errores” y el fracaso de los autores de la obra de la cerveza de crédito. Eso no era lo suficientemente bueno para la cerveza – ni uno de sus colegas de la Universidad Johns Hopkins, chakravarti aravinda, quien renunció a la junta editorial de la revista diciendo “la reciente romance con el trabajo de Mike cerveza que es un plagio no me impresionó.”

Autor bin liu, basado en el campus de Shenzhen del Instituto de Tecnología de Harbin, defendió el papel en el post que publicamos la semana pasada:

Obviamente, nuestra informes científicos de papel “recombinación de identificación basado en lugar de con huecos k-meros” no plagiar cualquier tipo de papel.

Salzberg nos dijo que si la revista no responde en un par de semanas, los firmantes probablemente dará un plazo dentro del cual tiene que responder.zona anóxica

Nuestros colegas no quieren renunciar. Ellos quieren que el papel se retraiga. Así que espero que eso es lo que sucederá.

Hemos contactado a Liu y los informes científicos, y se actualizará si responden.

Por favor, vea una actualización de esta historia.

Al igual que la retracción ver? Considere hacer una contribución deducible de impuestos para apoyar nuestro crecimiento. También puede seguirnos en Twitter, al igual que nosotros en Facebook, nos añade a su lector de RSS, crea en nuestra página web para un correo electrónico cada vez que hay un mensaje nuevo, o suscribirse a nuestro resumen diario. Haga clic aquí para revisar nuestra política de comentarios. Para un vistazo a lo que estamos trabajando, haga clic aquí.

Toda la comparación es bastante largo y voy a dejar que Mike cerveza decidir cómo quiere compartir eso. Pero los dos resúmenes solo hacen que sea bastante claro que la ciencia.zona anóxica informes de papel partes del documento computacional PLoS Biology anteriores copiado. A continuación se presentan extractos de los:

2014 artículo de la cerveza de Michael y sus colegas: https://doi.Org/10.1371/journal.Pcbi.1004035

Abstract (extracto):

… k-tarios son características convenientes y ampliamente utilizado para el modelado de las propiedades y funciones de las secuencias de ADN y proteínas. Sin embargo, k-tarios sufren de la limitación inherente de que si el parámetro k se incrementa para resolver las características más largos, la probabilidad de observar cualquier k-mer específico se hace muy pequeña, y el recuento de k-mer se acercan a una variable binaria, con la mayoría de k-tarios ausente y unos pocos presente una vez. Por lo tanto, cualquier enfoque de aprendizaje estadístico utilizando k-tarios como características vuelve susceptible a la formación conjunto de frecuencias k-mer ruidosos una vez k se hace grande.zona anóxica para hacer frente a este problema, se introduce conjuntos de características alternativas utilizando k-tarios con huecos, un nuevo clasificador, gkm-SVM ….

Wang, Xu y Liu, informes científicos, 31 de Marzo de 2016

Abstract (extracto)

La función de k-mer es una de las características más útiles para el modelado de las propiedades y la función de secuencias de ADN. Sin embargo, adolece de la limitación inherente. Si el valor de longitud de palabra k es grande, las ocurrencias de k-tarios están cerrados a una variable binaria, con unos pocos k-tarios presentan una vez y la mayoría de k-tarios están ausentes. Esto por lo general hace que el problema escasa y se reduce la precisión de la clasificación. Para resolver este problema, añadimos las brechas en k-mer e introducir una nueva característica llamada con huecos k-mer (GKM) …. Mediante el uso de esta característica, se presenta un nuevo predictor llamada SVM-GKM ….zona anóxica

Los números ( “editores”, papeles y dólares) son de hecho bastante alucinante.

En primer lugar el dinero … 21k papeles en $ 1700 cada uno hace para un flujo de ingresos $ 35M poco ordenado, para prácticamente ningún desembolso (los costos del servidor y algunos administradores de web). Es probablemente menos (ya que una gran cantidad de autores obtienen exención de tasas), pero aún más grande que la que PLoS publica periódicamente el volumen de negocios en los años 20. ¡Buen trabajo si puedes conseguirlo!

Hay un buen número de otras revistas que utilizan un modelo de edición similares – es decir, Una muy grande “comité de redacción”, que en realidad funcional no es más que una lista de colaboradores. Al recibo de revisión de estos editores, las decisiones finales se realizan entonces por una cohorte mucho menor de editores asociados. No deja de ser un problema de nomenclatura y una pequeña raqueta que funciona por ahora, siempre y cuando los comités PT no miran más allá del final de su nariz.zona anóxica

Yo apuesto a que ninguno de esos 8.000 editores se les paga (al igual que en la mayoría de otras revistas), y es muy poco probable involucrado con cualquier tipo de decisiones dentro de la revista decisión (es decir, asistencia a los Consejos ed, el establecimiento de políticas). Me pregunto si Morgenstein Burkhard haya tratado de llegar a la junta de scirep?